Загрузка...
Специалисты Института персонализированной онкологии Сеченовского Университета Минздрава России совместно с российскими и зарубежными коллегами разработали компьютерную модель, позволяющую в автоматическом режиме реконструировать тысячи внутриклеточных молекулярных путей. Она позволяет выявлять опухолевые маркеры нового поколения, необходимые для правильной диагностики и выбора стратегии лечения рака. Результаты исследования опубликованы в журнале Proteomes, сообщает пресс-служба Первого МГМУ.
«Процесс превращения нормальной клетки в раковую сопровождается мощной перестройкой работы генома. Эти изменения, как правило, затрагивают от 3000 генов и более. Их функционирование можно рассматривать как индивидуально, так и в контексте биологических процессов, за которые они отвечают», – пояснил главный научный сотрудник Института персонализированной онкологии Сеченовского Университета доктор биологических наук Антон Буздин.
Новый алгоритм оказался более эффективным по сравнению с исследованием отдельных генов. Кроме того, интерактомная модель также позволила многократно сократить время анализа и избежать ошибок, связанных с выбором неверных гипотез.
«Количество и качество онкомаркеров, получаемых с помощью нового алгоритма, гораздо выше по сравнению с используемыми сейчас при анализе активности индивидуальных генов. Благодаря быстроте работы и полноте отражения внутриклеточных молекулярных процессов в клетке данная модель может стать надежным инструментом для персонализированной диагностики онкологических заболеваний и для прогнозирования выживаемости пациентов», — подчеркнул Буздин.
В исследовании также приняли участие специалисты МФТИ, МГУ им. М. В. Ломоносова, ИБХ им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Европейской организации по исследованию и лечению рака (EORTC), медицинского центра «СМ-Клиника» и компании OmicsWay. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда.
